MyISAM和InnoDB是MySQL数据库中常见的两种存储引擎，它们在实现B+树索引方式上存在以下区别：
1. 索引结构：在MyISAM中，B+树只用于索引文件，而数据文件是按照数据插入的顺序组织的。而InnoDB使用B+树来组织数据文件本身，同时也使用B+树来管理索引。
2. 聚簇索引：InnoDB是支持聚簇索引的，而MyISAM则不支持。在InnoDB中，主键索引会直接决定表中数据的物理存储顺序，也就是说数据行是按照主键顺序存储的。而在MyISAM中，主键索引仅作为一种辅助索引来使用。
3. 事务支持：InnoDB是事务性存储引擎，支持ACID事务特性，包括原子性、一致性、隔离性和持久性。而MyISAM不支持事务，它的操作是自动提交的。
4. 并发控制：InnoDB支持行级锁定，可以提供更好的并发控制。而MyISAM只支持表级锁定，即对整个表进行锁定，影响并发性能。
5. 外键约束：InnoDB支持外键约束，可以通过定义外键关系来保持数据的一致性。而MyISAM不支持外键。
6. 容灾能力：InnoDB具有更好的容灾能力，支持崩溃恢复和故障转移。它具备自动故障检测和自动重启机制。而MyISAM则没有这些内建的机制。
根据具体的需求和应用场景，选择适合的存储引擎可以提高数据库的性能、稳定性和数据一致性。