Java并发运行中存在一些常见的安全问题，需要特别注意和处理。以下是几个主要的安全问题：
1. 竞态条件（Race Conditions）：竞态条件指的是多个线程在共享资源上进行读写操作时，对于操作的执行顺序和时间的不确定性可能导致不正确的结果。竞态条件可能会导致数据不一致、丢失更新和意外的行为。避免竞态条件可以采用同步机制，如锁（Locks）、互斥量（Mutex）和原子操作（Atomic Operations）。
2. 死锁（Deadlock）：死锁指的是两个或多个线程无法进行下去，因为它们正在等待彼此持有的资源。当多个线程同时竞争互斥资源时，如果没有正确的资源分配和释放策略，可能会引发死锁。避免死锁可以使用避免循环等待、按序获取锁等技术。
3. 内存可见性（Visibility）：在多线程环境中，如果一个线程修改了一个共享变量的值，另一个线程可能无法立即看到这个修改，从而导致不一致的结果。使用volatile关键字或显式的同步机制（如synchronized）可以保证共享变量的可见性。
4. 线程安全性（Thread Safety）：线程安全性指的是多个线程可以在没有额外同步措施的情况下安全地访问和修改共享资源。一些数据结构和操作可能不是线程安全的，并发访问时会导致数据损坏或意外行为。为了确保线程安全性，可以使用同步机制、原子操作和线程安全的集合类等。
5. 多线程同步（Thread Synchronization）：多个线程同时访问共享资源时，需要进行同步以确保正确的执行顺序。不正确的同步机制可能导致线程争用和数据不一致。可以使用锁、条件变量（Condition）和线程安全的队列等来进行多线程同步。
综上所述，Java并发运行中的安全问题包括竞态条件、死锁、内存可见性、线程安全性和多线程同步等。理解和处理这些问题，选择适当的并发控制机制，是确保多线程程序正确运行的重要一步。